病毒mRNA在宿主細(xì)胞聚核糖體上翻譯合成病毒結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白，結(jié)構(gòu)蛋白是病毒結(jié)構(gòu)的組成成分，非結(jié)構(gòu)蛋白雖然不是病毒的結(jié)構(gòu)成分，但是在病毒復(fù)制中具有重要功能，大多是一些催化、調(diào)節(jié)病毒復(fù)制的酶類和調(diào)控蛋白。

通常動(dòng)物病毒mRNA僅翻譯一條連續(xù)的完整的病毒多肽鏈，這種mRNA叫做單順反子mRNA (Monocistronic mRNA) 。分段基因級(jí)病毒，如流感病毒，核酸分為8個(gè)節(jié)段，每一節(jié)段轉(zhuǎn)錄一條mRNA，翻譯一種病毒蛋白。有的病毒，如脊髓灰質(zhì)炎病毒，病毒RNA本身做為,mRNA，首先翻譯出一大分子蛋白，然后在特殊位點(diǎn)被細(xì)胞或病毒蛋白水解酶裂解為許多小分子病毒蛋白，包括結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白。也有的病毒，如披膜病毒，基因組上有多處轉(zhuǎn)錄起始和終止碼，分別轉(zhuǎn)錄出單順反子mRNA并合成各自的病毒蛋白。DNA的轉(zhuǎn)錄發(fā)生在細(xì)胞核內(nèi)，轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)剪切拼接，并在3'端聚腺苷酸化，5'端加上甲基化帽，轉(zhuǎn)送入胞漿，合成病毒蛋白。

某些病毒蛋白合成后需要修飾，如磷酸化、糖基化等。由病毒和細(xì)胞的蛋白激酶完成磷酸化，這是活化或滅活某些蛋白的一種方式。病毒糖蛋白是在胞漿中與膜相連的核糖體上合成，經(jīng)粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、平滑內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基氏體到達(dá)細(xì)胞膜，在此過程中被糖基化。