本征的病因尚不明確。近年來有不少多發(fā)性內(nèi)分泌腺免疫性疾病的報道,如Schimidt綜合征即甲狀腺和腎上腺同時發(fā)生免疫性疾病。因而,推測本綜合征亦可能是由于免疫功能遭到破壞,同時產(chǎn)生了自身抗體(抗甲狀腺抗體和抗肝抗體)對自身組織發(fā)生免疫反應(yīng),而引起兩臟器同時發(fā)生自身免疫性疾病。肝病有程度不等的纖維化及淋巴細胞浸潤;甲狀腺呈彌漫性或局灶性甲狀腺炎性改變。